淋菌やクラミジアは、もちろん、腟だけでなく直腸にも感染します。それらを含んだ精液が入ってくれば、感染するのは当然でしょう。
女性の場合、クラミジアは（もちろん淋菌も）、子宮頸管を綿棒でこすって検査をします。血液で検査をするのは不適当です。でも、直腸にクラミジアがいるかどうかを、どうやって調べればいいのかは、まだよくわかっていないのです。あなたがもし、「直腸に感染しているかどうか検査をしてほしい」と病院に行っても、ドクターはおそらく困られるでしょう。検便でも出ないはずです。
最近、オーラルセックスによって、口の中に感染、それがまた（風俗などで）男性のペニスに感染する、というケースが増えています。この場合も、口の中の検査がとても難しいものです。喉をこすろうとすると、オエッとなってしまって、十分にできないからです。
腹痛が続いているようですが、クラミジアのためかどうかはわかりません。でも、放っておいてはいけないと思います。それが何の痛みなのか、ちゃんと調べてもらったほうがいいし、できれば、クラミジアにかかった人とアナルセックスをしたということを言って（検査はできなくとも）、それに効く薬を出してもらえればいいのですが……。ただし、それで痛みがおさまるかどうかは、試してみないとわかりません。たとえ言えなくとも、痛みのための治療を受けたほうがいいので、ぜひ病院に行かれますように。
それから、今後は、アナルでもオーラルでも、必ずコンドームを使ってください。コンドームは、避妊のためだけではなく、性感染症の予防のために、とても大切なものなのです。
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